EtherCATタスク以外のタスクの設定周期がEtherCATタスクより短いものが存在する場合に発生する可能性があります。
この場合、デバイスツリー内 Deviceをダブルクリック=>PLC設定タブ=>バスサイクルオプション内 バスサイクルタスクをEtherCATとすることで動作が改善されます。