「Control Loop Library」をご使用いただくことで実現可能です。
本ライブラリには、FIR、IIR、SOSフィルターなど、用途やノイズ特性に応じて選択できる複数のデジタルフィルター機能が用意されています。
CODESYS Installerから「Control Loop Library」をインストールすることでサンプルプログラムを取得可能です。

インストール後、サンプルプログラムは以下のフォルダに保存されます。
C:\Users\<ユーザー名>\CODESYS Examples\Control Loop Library
フィルター機能のサンプルは 「FilterSample.project」 です。