Q:
HALCONからコマンドラインのコマンドを実行する方法はありますか？

A:
system_callというオペレータで実行できます。
例えば、HDevelopを起動して system_call_read_image.hdevというファイルを実行する
には下記のように書きます。
文字列のシングルクォーテーション内がコマンドライン上のコマンドになります。

system_call ('hdevelop -run system_call_read_image.hdev')


これをHDevelopのプログラムの最終行に次に実行したいファイル名を書くことで
バッチファイルのようにAというプログラムが終わったらBを実行するという自動化を行うこともできます。