デフォルトゲートウェイを設定するには、puttyなどのターミナルソフトからログインして作業します。
なお、デフォルトゲートウェイを設定した場合の負荷は、ルーティングする情報量によって変動する可能性があります。

現在のデフォルトゲートウェイを確認する
> route

＜実行結果＞
root@Navitec:~# route
カーネルIP経路テーブル
受信先サイト  ゲートウェイ  ネットマスク  フラグ Metric Ref 使用数 インタフェース
default     192.168.1.254  0.0.0.0     UG  0   0    0 eth0　←現在のデフォルトゲートウェイ
link-local   0.0.0.0     255.255.0.0   U   1000  0    0 eth1
192.168.1.0   0.0.0.0     255.255.255.0  U   0   0    0 eth0
192.168.3.0   0.0.0.0     255.255.255.0  U   0   0    0 eth1

■一時的に変更する場合
現在のデフォルトゲートウェイを削除する
> route delete default
新たなデフォルトゲートウェイを設定する
> route add default gw 192.168.1.1

■設定ファイルにより変更する場合
> nano /etc/network/interfaces

＜一部抜粋＞
​# The primary network interface
allow-hotplug eth0
#iface eth0 inet dhcp
iface eth0 inet static
address 192.168.1.196
netmask 255.255.255.0
gateway 192.168.1.1 ←必要に応じて追加

allow-hotplug eth1
#iface eth1 inet dhcp
iface eth1 inet static
address 192.168.3.196
netmask 255.255.255.0
geteway 192.168.3.1​ ←必要に応じて追加