可能です。
設定したいIEC言語ごとに設定項目が異なります。

・ST言語・変数宣言部(テキストエディター)
"ツール"メニュー＞"オプション" ＞"テキスト エディター"を選択します。
"テキスト領域"タブ＞フォントから設定を行うことが可能です。

・FBD、LD、ILエディター
"ツール"メニュー＞"オプション"＞"FB、LD、およびIL エディター" を選択します。
"全般"タブ＞フォントから設定を行うことが可能です。

※項目名はCODESYSのバージョン、言語設定により異なる場合がございます。環境に合わせて読み替えて設定してください。