CODESYSにおいて、RETAIN領域の値をリセットするかどうかの違いです。
ウォームリセットでは、TRITONを適切な方法でRETAIN保存・再起動したときと同様にRETAIN領域の値が保持されます。
コールドリセットでは、ダウンロード直後のようにRETAIN領域は初期値に設定されます。

どちらのリセット方法の場合でもPERSISTENT RETAIN領域の変数は保持されます。