Q:
HALCONのスレッドの縛りについて教えてください。

A:
set_system()にてthread_numでAOPに使用するスレッドを縛ることができますが、使用するコアまでを指定することはできません。
スレッドはコアを移動するので、例えばfor文などで周回実行するような場合にはタスクマネージャーで確認するとすべてのコアが使用されているように見えてしまいます。
しかしながら、同時に動いているのはthread_numで指定されたスレッド数となりますので、HALCONの処理のみで負荷率が100%になることはないかと存じます。
タスクマネージャはあくまでサンプリング間隔の平均を取っているため、同時にthread_num以上動いているように見えてしまします。