Q:
2台目以降のカメラを利用する場合、プログラム側からどの様に制御すれば宜しいでしょうか。
A:
GigEの場合シリアル番号がとれないため、FullNameの中に含まれるIPアドレスとマッチングします。
.NETの場合IPアドレスも取れるので、そちらでも可能です。
camerasというCameraのListを作成し、cameras(0), cameras(1)の様にアクセスできます。

記述については、pylon.NETのHELPも参考にされてください。
C#の文法で記載されているため、文法的な翻訳が必要ですが、クラスとしては同じです。